надо в файле /etc/apache2/ports.conf заменить

NameVirtualHost *:80
Listen 80

на

NameVirtualHost *:2080
Listen 2080

, где 2080 новый номер порта, внести соответствующие изменения в конфигурации виртуальных хостов (VirtualHost) для сайтов и перезагрузить конфигурацию Apache:

/etc/init.d/apache2 reload

если используется Joomla + VirtueMart, то надо в файле administrator/components/com_virtuemart/virtuemart.cfg.php изменить параметры URL и SECUREURL.